Hotărârea privind numirea Ligiei Deca secretar general al Comisiei Naţionale a României pentru UNESCO a fost publicată în Monitorul Oficial şi vine după ce Madlen Şerban a fost eliberată, la cerere, din această funcţie.

Din 29 iunie 2015, Ligia Deca a fost consilier de stat, iar pe 23 decembrie 2019 a fost numită în funcţia de consilier prezidenţial pentru educaţie şi cercetare în echipa lui Klaus Iohannis.

La Preşedinţie, Deca a coordonat proiectul România Educată.

După demisia lui Sorin Cîmpeanu, pe 3 octombrie 2022, Deca a fost numită la conducerea Ministerului Educaţiei, fiind propusă şi susţinută de PNL.